Die Bezirksregierung Köln als obere Bodenschutzbehörde ordnet Maßnahmen zur Untersuchung, Bewertung und Sanierung von schädlichen Bodenveränderungen oder Altlasten an. Sie bewilligt finanzielle Zuwendungen für Maßnahmen des Bodenschutzes.

Die Bezirksregierung Köln erteilt auf der Grundlage des Bundes-Immissionsschutzgesetzes (BImSchG) Genehmigungen für bedeutsame Anlagen zur Lagerung, Behandlung und zum Umschlag von Abfällen.

Die Bezirksregierung Köln überwacht mehr als 350 besonders bedeutsame Anlagen zum Lagern, Behandeln und Umschlagen von Abfällen.

Die Bezirksregierung Köln führt die Aufsicht über Wasser- und Bodenverbände nach dem Wasserverbandsgesetz (WVG).

Im Jahr 2000 wurde durch die Europäische Union die Wasserrahmenrichtlinie (WRRL) verabschiedet. Wesentliches Ziel der Richtlinie ist die Wiederherstellung des guten ökologischen und chemischen Zustandes bzw. Potentials der Gewässer in Europa.

Die Bezirksregierung Köln ist Genehmigungsbehörde für Errichtung und Betrieb von werksgeländeüberschreitenden Rohrfernleitungsanlagen zum Transport von Gasen oder Flüssigkeiten im Regierungsbezirk Köln.

Die Bezirksregierung Köln ist zuständig für Vorhaben zum Gewässerausbau sowie der Förderung von Maßnahmen des Wasserbaus und der naturnahen Gewässerentwicklung. Sie berät die Maßnahmenträger über die Umsetzung und Antragsstellung.

Die Bezirksregierung Köln nimmt für das Land Nordrhein-Westfalen die Aufgaben der Gewässerunterhaltung der Sieg und ihres naturnahen Ausbaus nach den Vorgaben der europäischen Wasserrahmenrichtlinie wahr.

Die Bezirksregierung Köln begleitet wasserwirtschaftliche Sonderprojekte im Auftrag des Landes Nordrhein-Westfalen.